Windows, Linux’ü yüksek performanslı bilgişlem (HPC) alanındaki baskın rolünden hiçbir zaman edemeyebilir ancak Microsoft’un dual-boot stratejisi bu alanda aşama kaydetmetlerini sağlıyor. IBM’den gelen açıklamaya göre İsveç’teki bir üniversite araştırma grubu için geliştirdikleri sistem şu ana kadar ki en büyük Windows/Linux HPC dual-boot sistem olabilir. IBM’in geliştirdiği sistem her biri 2.5 GHz’de çalışan ve 50 watt güç tüketen 5,376 Intel Xeon dört çekirdekli işlemcileri kullanıyor. 46 teraflop’a ulaşma yeteneğine sahip sistem Windows HPC Server 2008’in bir beta sürümünü çalıştırıyor.
Tüm HPC sistemlerin yaklaşık yüzde 85’inde Linux kullanıyor. Windows’un oranı ise yüzde 2’den daha az. Microsoft yaklaşık üç yıldır HPC ile ilgileniyor ancak bu alanda büyük bir büyüme görmüyorlar. Ancak uzmanlar firmanın sektörü çok yakında takip ettiğini çünkü oldukça fazla yatırım yaptıklarını ifade ediyor. Her ne kadar çoğu HPC uygulaması Linux üzerinde çalışıyor olsa da, bazı araştırmacılar kendi işlerini Windows makinelerinde gerçekleştiriyor. Dolayısıyla Windows’lu bir sunucunun var olması işleri kolaylaştırabilir. Dual-boot stratejisi HPC’yi her iki OS kullanıcılarına açıyor.